Análisis in silico de la composición y variabilidad de las secuencias de la proteína fibra de adenovirus tipo 4 y 7 causantes de infecciones respiratorias agudas en humanos

Abstract

En los últimos años se han reportado un gran número de infecciones respiratorias agudas causadas principalmente por los adenovirus humanos del tipo 4 y 7, debido a su gran capacidad de infección gracias a su proteína Fibra que se une a los receptores de la célula huésped. Objetivo: Determinar por análisis in sílico la composición y variabilidad de las secuencias de aminoácidos y estructuras de la proteína Fibra de HAdV tipo 4 y 7. Metodología: Se seleccionaron las secuencias completas de la proteína Fibra de HAdV tipo 4 y 7 depositadas en la base de datos National Center Bioinformatic Institute. A través de servidores on-line se recopiló las características, modificaciones postraduccionales, dominios y motivos. Se realizó 3 alineamientos múltiples entre las secuencias seleccionadas. Finalmente, se predijo, refino, analizó y evaluó la estructura 3D de la proteína Fibra de ambos tipos. Resultados: Se seleccionó un total de 44 secuencias entre ambos tipos. La proteína Fibra es una proteína homotrímera estructurada en 3 regiones, con 5 modificaciones postraduccionales, 2 dominios y 7 motivos, así mismo, por medio de los alineamientos múltiples se identificaron las variaciones de algunos aminoácidos de las secuencias seleccionadas. Los primeros aminoácidos de sus estructuras 3D obtuvieron un puntaje < 70 pLDDT y el resto ente 70 – 98 pLDDT. Por otra parte, la relación 3D-1D fue de un 61.25% y 56.41%, así también alcanzaron el 86% y 87% en las regiones más favorecidas para la proteína Fibra de HAdV de tipo 4 y 7 en el orden dado.