Caracterización genética de 25 STR autosómicos analizados en las poblaciones de Monsefú y Batangrande. Junio 2023 – Enero 2024

Abstract

La caracterización genética de la población ancestral en el Perú es muy limitada, las pocas investigaciones realizadas sólo explican sus orígenes. Una de las más renombrada del continente y de quien no se tiene ningún registro genético poblacional es la mochica. Este estudio tuvo como objetivo caracterizar genéticamente con 25 STR autosómicos a las poblaciones de Monsefú y Batangrande, se tomaron muestras sanguíneas en tubos con EDTA a 36 individuos no emparentados. La extracción y amplificación de ADN se realizaron con el Kit de Purificación Wizard® y el Kit de amplificación de PCR VeriFiler Express en el termocilcador VERITI. La electroforesis capilar se llevó a cabo en el analizador genético ABI 3500 XL. Los datos se visualizaron en el software GeneMapperTM, se organizaron en Microsoft Excel y se exportaron al programa Arlequín v3.5.2.2. Los resultados mostraron que D21S11 y Penta E; ambos con 12 alelos, fueron los STR más polimórficos en Monsefú y Batangrande respectivamente, el alelo 10 (D2S441) fue el más frecuente en ambas poblaciones; además se reportaron 23 alelos únicos en la población de Monsefú y 35 en Batangrande. Respecto a la heterocigosidad se encontraron valores de 0.54545 (vWA) a 0.95455 (FGA) en Monsefú y de 0.35714 (D2S441) a 1 (D8S1179) en Batangrande. Todos los STR analizados se encontraron en equilibrio de H-W luego de aplicar la corrección de Bonferroni (p>0.0022). El índice de contenido polimórfico tuvo valores promedio por encima del 50% y el poder de discriminación combinado un valor de 0.999999999. Concluyendo que las poblaciones analizadas presentan alelos propios, alta variabilidad (heterocigosidad > 70%). Además, un valor p>0.000198 en la prueba de desequilibrio de ligamiento permitió descartar asociación entre todos los pares de loci. Valores obtenidos en los parámetros forenses permite considerar que el panel de STR analizados son buenos discriminantes.

The genetic characterization of the ancestral population in Peru is very limited; the few investigations carried out only explain its origins. One of the most renowned on the continent and for which there is no population genetic record is the Mochica. This study aimed to genetically characterize the populations of Monsefú and Batangrande with 25 autosomal STRs. Blood samples were taken in tubes with EDTA from 36 unrelated individuals. DNA extraction and amplification were performed with the Wizard® Purification Kit and the VeriFiler Express PCR Amplification Kit in the VERITI thermocycler. Capillary electrophoresis was carried out on the ABI 3500 XL genetic analyzer. The data were visualized in the GeneMapperTM software, organized in Microsoft Excel and exported to the Arlequín v3.5.2.2 program. The results showed that D21S11 and Penta E; both with 12 alleles, were the most polymorphic STRs in Monsefú and Batangrande respectively, allele 10 (D2S441) was the most frequent in both populations; In addition, 23 unique alleles were reported in the population of Monsefú and 35 in Batangrande. Regarding heterozygosity, values were found from 0.54545 (vWA) to 0.95455 (FGA) in Monsefú and from 0.35714 (D2S441) to 1 (D8S1179) in Batangrande. All analyzed STRs were found in H-W equilibrium after applying the Bonferroni correction (p>0.0022). The polymorphic content index had average values above 50% and the combined discrimination power a value of 0.999999999. Concluding that the analyzed populations have their own alleles, high variability (heterozygosity > 70%). Furthermore, a p value >0.000198 in the linkage disequilibrium test allowed us to rule out association between all pairs of loci. Values obtained in the forensic parameters allow us to consider that the panel of STRs analyzed are good discriminators.