Análisis genómico y funcional de Pseudomonas aeruginosa B111 aislada de las salinas de Bayovar, Piura – Perú

Abstract

Pseudomonas spp. es un grupo de bacterias que pueden adaptarse a condiciones ambientales extremas y resistir a diferentes agentes antibacterianos. Se encuentran en muchos entornos ambientales y pueden aislarse de diferentes fuentes vivas, como plantas, animales y humanos. En una investigación previa en 2015, se aisló la cepa Pseudomonas aeruginosa B111 de las salinas de Bayovar, Piura - Perú. El presente estudio tuvo como objetivos analizar estructural y funcionalmente el genoma de P. aeruginosa B111, usando distintas herramientas bioinformáticas, las cuales identificaron un genoma completo de 6.67 Mb con un contenido de GC del 66.1%, 6061 genes codificantes, 45 Islas genómicas, 05 Regiones CRISPR y 03 profagos intactos. Asimismo, el genoma de P. aeruginosa B111 contiene genes presentes en el metabolismo de compuestos aromáticos, síntesis de triptófano, producción de biosurfactantes, sideróforos, polímeros biodegradables; así como genes importantes para biorremediación, desintoxicación de cianuro, degradación del diclorometano; y en el campo clínico, mostró objetivos potenciales para el desarrollo de agentes antimicrobianos y la producción de azurina con posibles propiedades anticancerígenas. En conclusión, P. aeruginosa B111 exhibe un potencial biotecnológico significativo para aplicaciones en biorremediación y en el campo clínico, destacando su versatilidad genética y adaptabilidad a condiciones ambientales extremas.

Pseudomonas spp. is a group of bacteria that can adapt to extreme environmental conditions and resist various antibacterial agents. It is found in many environmental settings and can be isolated from different living sources, such as plants, animals, and humans. In a previous study conducted in 2015, the strain P. aeruginosa B111 was isolated from the Bayovar salt flats in Piura, Peru. The present study aimed to analyze the genome of P. aeruginosa B111 structurally and functionally using various bioinformatics tools. These tools identified a complete genome of 6.67 Mb with a GC content of 66.1%, 6,061 coding genes, 45 genomic islands, 5 CRISPR regions, and 3 inactive prophages. Additionally, the genome of P. aeruginosa B111 contains genes involved in the metabolism of aromatic compounds, tryptophan synthesis, production of biosurfactants, siderophores, and biodegradable polymers, as well as genes crucial for bioremediation, cyanide detoxification, and dichloromethane degradation. In the clinical field, it also revealed potential targets for the development of antimicrobial agents and the production of azurin, which may have anticancer properties. In conclusion, P. aeruginosa B111 demonstrates significant biotechnological potential for applications in bioremediation and the clinical field, highlighting its genetic versatility and adaptability to extreme environmental conditions.